羅伊氏乳桿菌（Lactobacillus reuteri）屬于革蘭氏陽性菌，發(fā)酵特性為異性乳酸發(fā)酵，常存在于人或其它動物腸道中。已有大量研究證明，L. reuteri具有一定的益生功效，例如調節(jié)宿主免疫系統(tǒng)、產生廣譜抗菌化合物、預防腹瀉和結腸炎等。近年來，L.reuteri已被作為脊椎動物腸道共生體的模型來研究生態(tài)和進化。然而，關于食草動物腸道中L.reuteri遺傳進化研究卻鮮有報道。

    基于以上現(xiàn)狀，內蒙古農業(yè)大學乳品生物技術與工程教育部重點實驗室研究人員將分離自山羊、綿羊、馬、牛腸道中的16株L.reuteri進行基因組重測序，結合已公布的17株雜食動物腸道分離株和4株酸面團分離株進行比較基因組學分析。結果發(fā)現(xiàn)來源于不同宿主的L.reuteri進化歷程各異，且某些與細菌黏附特性有關的細胞表面蛋白編碼基因和碳水化合物活性酶編碼基因具有宿主特異性。該研究進一步證實，不同生境來源的L.reuteri遺傳多樣性與其生存環(huán)境息息相關。

    該研究“Comparative genomics of the herbivore gut symbiont Lactobacillus  reuteri reveals genetic diversity and lifestyle adaptation”已于2018年3月發(fā)表在《Frontiers in Microbiology》（JCR2區(qū)，IF:4.019）。

原文鏈接：
https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01151

FIGURE 1 .Phylogeny of Lactobacillus reuteri was inferred using a maximum likelihood method.


FIGURE 2 .Shared and unique gene families of Lactobacillus reuteri strains from different clades of herbivore-derived L. reuteri strains (A). Venn plot showing shared
and unique genes distribution (B). A heatmap representation of BLASTN comparison of specific genes against sequenced  L. reuteri genomes.